Papildu ierobežojumu varianti patur pazīstamo 9x9 režģi, bet virs standarta rindas, kolonnas un bloka prasībām pievieno papildu noteikumus. Šie papildu noteikumi ierobežo, kur cipari var atrasties, radot mīklas, kas šķiet pazīstamas, tomēr izteikti atšķirīgas. Paradoksāli, vairāk ierobežojumu dažkārt var padarīt mīklu vieglāku: ir vairāk veidu, kā izslēgt kandidātus.
Vienkāršākais variants pievieno vienu noteikumu: abām galvenajām režģa diagonālēm arī jāsatur cipari no 1 līdz 9 tieši pa vienam reizei. Režģi bieži atzīmē ar X, lai izceltu diagonāles. Šis vienīgais papildinājums rada jaunus secināšanas ceļus, īpaši šūnām diagonāles krustpunktā ar rindu, kolonnu un bloku.
Diagonālais sudoku ir ieteicamais pirmais variants risinātājiem, kas droši jūtas ar klasisko sudoku.
Hyper sudoku pievieno režģim 4 papildu 3x3 apgabalus, izceltus kontrastējošā krāsā. Šie apgabali pārklājas ar standarta blokiem, radot papildu ierobežojumus. Katram izceltajam apgabalam jāsatur cipari no 1 līdz 9, tieši kā rindām, kolonnām un blokiem. Pārklājošies ierobežojumi padara daudzas šūnas vieglāk atrisināmas, tāpēc Hyper sudoku mīklas bieži sākas ar mazāk dotajiem cipariem.
Jigsaw sudoku aizstāj 9 3x3 blokus ar 9 neregulāras formas apgabaliem. Katrai rindai un kolonnai joprojām jāsatur no 1 līdz 9, un katram neregulārajam apgabalam arī. Nestandarta formas lauž pazīstamos modeļus un liek domāt citādi par to, kuras šūnas mijiedarbojas. Jigsaw mīklas ir vizuāli izteiksmīgas un pārsteidzoši atsvaidzinošas pieredzējušiem risinātājiem.
Windoku ir līdzīgs Hyper sudoku, bet 4 papildu apgabalus novieto pozīcijās, kas atgādina logu rūtis, vienmērīgi izvietotas režģī. Tāpat kā Hyper sudoku, katram logu apgabalam jāsatur no 1 līdz 9. Konkrētais izvietojums rada unikālas ierobežojumu mijiedarbības, kas atšķiras no Hyper sudoku, neraugoties uz līdzīgo ideju.
Anti-Knight sudoku pievieno šaha iedvesmotu ierobežojumu: nevienās 2 šūnās, kas atrodas zirga gājiena attālumā (L formā), nedrīkst būt viens un tas pats cipars. Šis noteikums attiecas uz visu režģi, ne tikai uz apgabaliem. Tas rada ierobežojumu tīklu, ko ir grūti iztēloties, bet kas ir spēcīgs izslēgšanai. Anti-Knight mīklām vajadzīga rūpīga telpiskā domāšana.
Anti-King sudoku neļauj identiskiem cipariem parādīties pa diagonāli blakus esošās šūnās. Tā kā katrai šūnai ir līdz 4 diagonāliem kaimiņiem, šis ierobežojums ir tālejošs un bieži ļauj mīklām sākties ar ļoti maz dotajiem. Kopā ar standarta noteikumiem Anti-King ierobežojums rada blīvus loģiskus savienojumus pa visu režģi.
Daudzi mīklu veidotāji apvieno vairākus ierobežojumus, piemēram, Diagonal Anti-Knight sudoku vai Hyper Jigsaw sudoku. Šie hibrīdvarianti ir starp grūtākajām pieejamajām sudoku mīklām un prasa risinātājiem vienlaikus žonglēt ar vairākām ierobežojumu sistēmām.