附加约束的变体保留熟悉的 9x9 盘面，但在标准的行、列和宫要求之上叠加额外的规则。这些额外规则限制数字能放的位置，做出既熟悉又截然不同的题目。矛盾的是，约束越多，有时题目反而更容易——排除候选数的办法更多了。
最直接的变体只加一条规则：盘面的两条主对角线也必须恰好包含数字 1 到 9 各一次。盘面常常用一个 X 来突出对角线。这一个小小的改动创造出新的推理路径，尤其是对角线与行、列、宫相交处的格子。
对角线数独是推荐给已经熟悉经典数独的玩家的第一个变体。
超级数独在盘面上增加四个额外的 3x3 区域，用对比色突出显示。这些区域与标准的宫重叠，产生额外的约束。每个突出显示的区域都必须包含数字 1 到 9，和行、列、宫一样。重叠的约束让许多格更容易解出，所以超级数独的题目往往以更少的已知数开局。
异形数独把九个 3x3 的宫换成九个形状不规则的区域。每一行和每一列仍然必须包含 1 到 9，每个不规则区域也必须如此。非标准的形状打破了熟悉的图形，迫使你换个方式去想哪些格子相互影响。异形数独视觉上很醒目，对经验丰富的玩家来说出乎意料地清新。
窗口数独与超级数独相似，但把四个额外区域放在像窗格的位置上——在盘面内等距分布。和超级数独一样，每个窗口区域都必须包含 1 到 9。尽管概念相似，具体的位置产生了与超级数独不同的独特约束互动。
反马步数独加入一条受国际象棋启发的约束：相隔一个马步（L 形）的两个格不能含有相同的数字。这条规则适用于整个盘面，而不只是区域之内。它形成一张难以想象、但排除起来威力很大的约束网。反马步数独需要仔细的空间推理。
反王步数独禁止相同的数字出现在斜向相邻的格子中。由于每个格最多有四个斜向邻格，这个约束影响深远，常常让题目以很少的已知数开局。与标准规则结合后，反王步约束在整个盘面上形成稠密的逻辑联系。
许多出题者会把多种约束组合起来——例如对角线反马步数独或超级异形数独。这些混合变体是现有数独题中最具挑战性的之一，要求解题者同时兼顾好几套约束系统。